Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN8P56748 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN8P56748 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN8P56748 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms