Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN15P56746 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN15P56746 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN15P56746 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms