Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLDN15P56746 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLDN15P56746 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLDN15P56746 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLDN15P56746 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CLDN15P56746 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLDN15P56746 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLDN15P56746 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLDN15P56746 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLDN15P56746 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLDN15P56746 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLDN15P56746 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLDN15P56746 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLDN15P56746 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLDN15P56746 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLDN15P56746 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLDN15P56746 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLDN15P56746 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLDN15P56746 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLDN15P56746 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLDN15P56746 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLDN15P56746 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLDN15P56746 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLDN15P56746 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLDN15P56746 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLDN15P56746 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLDN15P56746 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLDN15P56746 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN15P56746 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN15P56746 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN15P56746 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLDN15P56746 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN15P56746 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN15P56746 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN15P56746 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLDN15P56746 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CLDN15P56746 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN15P56746 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN15P56746 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN15P56746 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN15P56746 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN15P56746 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN15P56746 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN15P56746 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN15P56746 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN15P56746 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN15P56746 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN15P56746 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN15P56746 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN15P56746 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN15P56746 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN15P56746 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN15P56746 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN15P56746 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN15P56746 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN15P56746 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN15P56746 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN15P56746 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN15P56746 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN15P56746 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN15P56746 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN15P56746 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN15P56746 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN15P56746 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN15P56746 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN15P56746 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN15P56746 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN15P56746 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN15P56746 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN15P56746 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN15P56746 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN15P56746 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN15P56746 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN15P56746 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN15P56746 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN15P56746 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN15P56746 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN15P56746 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN15P56746 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLDN15P56746 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDN15P56746 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDN15P56746 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLDN15P56746 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDN15P56746 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDN15P56746 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLDN15P56746 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLDN15P56746 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLDN15P56746 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLDN15P56746 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN15P56746 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN15P56746 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN15P56746 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN15P56746 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN15P56746 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN15P56746 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN15P56746 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN15P56746 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN15P56746 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN15P56746 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN15P56746 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms