Protein–RNA interactions for Protein: P56557

TMEM50B, Transmembrane protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM50BP56557 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM50BP56557 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM50BP56557 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM50BP56557 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms