Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA13P31271 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA13P31271 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA13P31271 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA13P31271 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXA13P31271 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXA13P31271 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXA13P31271 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXA13P31271 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXA13P31271 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXA13P31271 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXA13P31271 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXA13P31271 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HOXA13P31271 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXA13P31271 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXA13P31271 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXA13P31271 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXA13P31271 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXA13P31271 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXA13P31271 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms