Protein–RNA interactions for Protein: P29401

TKT, Transketolase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TKTP29401 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TKTP29401 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TKTP29401 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TKTP29401 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TKTP29401 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TKTP29401 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TKTP29401 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TKTP29401 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TKTP29401 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TKTP29401 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TKTP29401 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TKTP29401 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TKTP29401 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TKTP29401 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TKTP29401 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TKTP29401 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TKTP29401 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TKTP29401 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TKTP29401 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TKTP29401 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TKTP29401 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TKTP29401 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TKTP29401 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TKTP29401 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TKTP29401 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TKTP29401 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TKTP29401 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TKTP29401 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TKTP29401 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TKTP29401 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TKTP29401 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TKTP29401 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TKTP29401 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TKTP29401 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TKTP29401 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TKTP29401 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TKTP29401 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TKTP29401 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TKTP29401 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TKTP29401 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TKTP29401 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TKTP29401 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TKTP29401 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TKTP29401 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TKTP29401 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TKTP29401 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TKTP29401 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TKTP29401 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TKTP29401 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TKTP29401 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TKTP29401 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TKTP29401 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TKTP29401 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TKTP29401 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TKTP29401 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TKTP29401 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TKTP29401 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TKTP29401 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TKTP29401 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TKTP29401 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TKTP29401 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TKTP29401 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TKTP29401 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TKTP29401 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TKTP29401 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TKTP29401 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TKTP29401 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TKTP29401 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TKTP29401 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TKTP29401 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TKTP29401 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TKTP29401 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TKTP29401 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TKTP29401 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TKTP29401 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TKTP29401 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TKTP29401 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TKTP29401 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TKTP29401 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TKTP29401 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TKTP29401 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TKTP29401 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TKTP29401 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TKTP29401 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TKTP29401 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TKTP29401 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TKTP29401 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TKTP29401 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms