Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMB4P28070 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMB4P28070 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMB4P28070 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMB4P28070 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMB4P28070 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMB4P28070 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMB4P28070 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMB4P28070 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMB4P28070 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms