Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PSMB4P28070 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PSMB4P28070 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PSMB4P28070 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSMB4P28070 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PSMB4P28070 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PSMB4P28070 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PSMB4P28070 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PSMB4P28070 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PSMB4P28070 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSMB4P28070 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSMB4P28070 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PSMB4P28070 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PSMB4P28070 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSMB4P28070 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PSMB4P28070 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PSMB4P28070 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PSMB4P28070 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSMB4P28070 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSMB4P28070 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSMB4P28070 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PSMB4P28070 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PSMB4P28070 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PSMB4P28070 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PSMB4P28070 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSMB4P28070 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PSMB4P28070 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSMB4P28070 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSMB4P28070 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSMB4P28070 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSMB4P28070 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSMB4P28070 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PSMB4P28070 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSMB4P28070 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSMB4P28070 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSMB4P28070 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSMB4P28070 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSMB4P28070 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSMB4P28070 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSMB4P28070 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSMB4P28070 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PSMB4P28070 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PSMB4P28070 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSMB4P28070 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSMB4P28070 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSMB4P28070 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSMB4P28070 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSMB4P28070 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSMB4P28070 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSMB4P28070 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSMB4P28070 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSMB4P28070 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSMB4P28070 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSMB4P28070 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSMB4P28070 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSMB4P28070 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMB4P28070 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMB4P28070 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSMB4P28070 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSMB4P28070 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSMB4P28070 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSMB4P28070 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSMB4P28070 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSMB4P28070 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSMB4P28070 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSMB4P28070 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSMB4P28070 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMB4P28070 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSMB4P28070 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSMB4P28070 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMB4P28070 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMB4P28070 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMB4P28070 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMB4P28070 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMB4P28070 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMB4P28070 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMB4P28070 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMB4P28070 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSMB4P28070 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMB4P28070 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMB4P28070 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMB4P28070 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMB4P28070 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSMB4P28070 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMB4P28070 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMB4P28070 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMB4P28070 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMB4P28070 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PSMB4P28070 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMB4P28070 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMB4P28070 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMB4P28070 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMB4P28070 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMB4P28070 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMB4P28070 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMB4P28070 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMB4P28070 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMB4P28070 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMB4P28070 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMB4P28070 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms