Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDCP20941 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDCP20941 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDCP20941 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCP20941 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCP20941 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCP20941 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCP20941 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCP20941 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCP20941 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCP20941 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDCP20941 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDCP20941 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDCP20941 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PDCP20941 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDCP20941 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDCP20941 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDCP20941 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDCP20941 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDCP20941 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDCP20941 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDCP20941 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDCP20941 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDCP20941 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDCP20941 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDCP20941 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCP20941 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCP20941 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCP20941 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCP20941 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDCP20941 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDCP20941 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDCP20941 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCP20941 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCP20941 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCP20941 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCP20941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDCP20941 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDCP20941 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDCP20941 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PDCP20941 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDCP20941 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDCP20941 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDCP20941 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDCP20941 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDCP20941 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDCP20941 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDCP20941 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PDCP20941 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDCP20941 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDCP20941 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDCP20941 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCP20941 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCP20941 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCP20941 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCP20941 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDCP20941 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDCP20941 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCP20941 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCP20941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCP20941 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCP20941 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCP20941 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PDCP20941 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDCP20941 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDCP20941 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDCP20941 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDCP20941 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCP20941 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCP20941 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCP20941 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCP20941 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCP20941 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCP20941 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCP20941 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCP20941 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCP20941 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDCP20941 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDCP20941 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCP20941 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCP20941 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms