Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE6AP16499 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE6AP16499 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE6AP16499 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE6AP16499 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE6AP16499 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE6AP16499 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE6AP16499 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE6AP16499 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PDE6AP16499 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDE6AP16499 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE6AP16499 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDE6AP16499 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PDE6AP16499 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDE6AP16499 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDE6AP16499 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE6AP16499 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE6AP16499 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE6AP16499 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE6AP16499 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE6AP16499 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.8 ms