Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP2P16035 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
TIMP2P16035 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMP2P16035 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMP2P16035 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TIMP2P16035 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms