Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFHP12036 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFHP12036 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFHP12036 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFHP12036 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFHP12036 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFHP12036 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFHP12036 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFHP12036 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFHP12036 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFHP12036 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFHP12036 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFHP12036 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFHP12036 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFHP12036 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFHP12036 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFHP12036 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFHP12036 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFHP12036 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFHP12036 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFHP12036 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFHP12036 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFHP12036 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFHP12036 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFHP12036 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFHP12036 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFHP12036 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFHP12036 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFHP12036 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFHP12036 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFHP12036 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFHP12036 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFHP12036 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFHP12036 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFHP12036 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFHP12036 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFHP12036 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFHP12036 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFHP12036 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFHP12036 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFHP12036 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFHP12036 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFHP12036 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFHP12036 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFHP12036 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFHP12036 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFHP12036 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFHP12036 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFHP12036 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFHP12036 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFHP12036 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFHP12036 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFHP12036 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFHP12036 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFHP12036 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFHP12036 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFHP12036 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFHP12036 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFHP12036 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFHP12036 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFHP12036 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFHP12036 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFHP12036 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFHP12036 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFHP12036 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFHP12036 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFHP12036 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFHP12036 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFHP12036 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFHP12036 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFHP12036 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFHP12036 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFHP12036 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFHP12036 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFHP12036 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFHP12036 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFHP12036 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFHP12036 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFHP12036 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFHP12036 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFHP12036 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFHP12036 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFHP12036 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFHP12036 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFHP12036 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFHP12036 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFHP12036 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEFHP12036 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEFHP12036 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFHP12036 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFHP12036 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFHP12036 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFHP12036 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFHP12036 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFHP12036 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFHP12036 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFHP12036 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFHP12036 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFHP12036 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFHP12036 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms