Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00032P0C843 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00032P0C843 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00032P0C843 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms