Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG5P05408 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG5P05408 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG5P05408 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG5P05408 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG5P05408 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG5P05408 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG5P05408 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG5P05408 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG5P05408 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG5P05408 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG5P05408 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG5P05408 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG5P05408 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG5P05408 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG5P05408 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG5P05408 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG5P05408 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG5P05408 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG5P05408 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG5P05408 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG5P05408 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG5P05408 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG5P05408 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG5P05408 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG5P05408 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG5P05408 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG5P05408 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG5P05408 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG5P05408 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG5P05408 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG5P05408 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG5P05408 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG5P05408 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG5P05408 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG5P05408 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG5P05408 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG5P05408 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG5P05408 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG5P05408 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG5P05408 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG5P05408 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG5P05408 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG5P05408 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG5P05408 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG5P05408 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG5P05408 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG5P05408 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG5P05408 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG5P05408 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG5P05408 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG5P05408 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG5P05408 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG5P05408 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG5P05408 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG5P05408 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG5P05408 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG5P05408 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG5P05408 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG5P05408 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG5P05408 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG5P05408 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG5P05408 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG5P05408 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG5P05408 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG5P05408 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG5P05408 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG5P05408 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG5P05408 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG5P05408 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG5P05408 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG5P05408 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG5P05408 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG5P05408 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG5P05408 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG5P05408 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG5P05408 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG5P05408 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG5P05408 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG5P05408 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG5P05408 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG5P05408 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG5P05408 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG5P05408 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG5P05408 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG5P05408 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG5P05408 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG5P05408 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG5P05408 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG5P05408 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG5P05408 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG5P05408 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG5P05408 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG5P05408 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG5P05408 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG5P05408 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG5P05408 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG5P05408 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG5P05408 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG5P05408 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms