Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN12O95859 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN12O95859 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN12O95859 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN12O95859 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms