Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LCA5LO95447 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCA5LO95447 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCA5LO95447 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCA5LO95447 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCA5LO95447 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LCA5LO95447 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCA5LO95447 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCA5LO95447 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LCA5LO95447 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LCA5LO95447 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms