Protein–RNA interactions for Protein: O43423

ANP32C, Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member C, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANP32CO43423 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ANP32CO43423 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ANP32CO43423 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ANP32CO43423 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ANP32CO43423 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ANP32CO43423 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ANP32CO43423 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ANP32CO43423 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ANP32CO43423 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ANP32CO43423 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
ANP32CO43423 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms