Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 35.1
PRPF4O43172 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.434e-8■■■■■ 35.1
PRPF4O43172 CTNNB1-206ENST00000431914 634 ntTSL 410.67□□□□□ -0.74e-8■■■■■ 35.1
PRPF4O43172 CTNNB1-204ENST00000405570 2513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 35.1
PRPF4O43172 CTNNB1-207ENST00000433400 596 ntTSL 46.03□□□□□ -1.444e-8■■■■■ 35.1
PRPF4O43172 CTNNB1-205ENST00000426215 563 ntTSL 44.26□□□□□ -1.734e-8■■■■■ 35.1
PRPF4O43172 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 221.64■■□□□ 1.054e-8■■■■■ 35.1
PRPF4O43172 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 315.04■□□□□ -08e-19■■■■■ 35
PRPF4O43172 SRRM2-213ENST00000573311 732 ntTSL 214.17□□□□□ -0.148e-19■■■■■ 35
PRPF4O43172 SRRM2-210ENST00000572721 841 ntTSL 213.37□□□□□ -0.278e-19■■■■■ 35
PRPF4O43172 SRRM2-211ENST00000572883 887 ntTSL 210.32□□□□□ -0.768e-19■■■■■ 35
PRPF4O43172 CPSF7-208ENST00000450000 574 ntTSL 420.99■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.189e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-225ENST00000545934 565 ntTSL 415.83■□□□□ 0.129e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.029e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 09e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-223ENST00000544669 1800 ntTSL 513.77□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-218ENST00000537641 1728 ntTSL 512.92□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-211ENST00000477890 1234 ntTSL 511.18□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-217ENST00000537162 801 ntTSL 38.77□□□□□ -1.019e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-216ENST00000536548 598 ntTSL 48.22□□□□□ -1.099e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-214ENST00000535222 940 ntTSL 36.96□□□□□ -1.39e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 55.85□□□□□ -1.479e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-222ENST00000544585 722 ntTSL 25.64□□□□□ -1.519e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.69e-7■■■■■ 34.9
PRPF4O43172 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 SCAP-202ENST00000320017 3430 ntTSL 215.67■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 SCAP-207ENST00000441517 3748 ntTSL 215.4■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.093e-10■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-10■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-10■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-10■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 ILF2-204ENST00000480213 1008 ntTSL 57□□□□□ -1.293e-10■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 PPP1R8-205ENST00000486634 459 ntTSL 36.32□□□□□ -1.43e-10■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 RAB40C-212ENST00000569575 692 ntTSL 222.77■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 RAB40C-210ENST00000566290 753 ntTSL 317.17■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 34.8
PRPF4O43172 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.081e-10■■■■■ 34.7
PRPF4O43172 LAMTOR4-204ENST00000466498 371 ntTSL 213.65□□□□□ -0.221e-10■■■■■ 34.7
PRPF4O43172 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 34.7
PRPF4O43172 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 511.07□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 34.7
PRPF4O43172 GYG2-208ENST00000520904 624 ntTSL 320.38■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 34.7
PRPF4O43172 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.692e-11■■■■■ 34.7
PRPF4O43172 TMEM259-208ENST00000592052 1637 nt23.83■■□□□ 1.419e-10■■■■■ 34.7
PRPF4O43172 ZNF692-225ENST00000533614 553 ntTSL 422■■□□□ 1.112e-8■■■■■ 34.7
PRPF4O43172 ZNF692-218ENST00000496053 694 ntTSL 317.66■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 34.7
PRPF4O43172 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.43e-12■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 CHKA-206ENST00000531341 524 ntTSL 319.91■□□□□ 0.783e-12■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.383e-12■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-215ENST00000492536 1069 ntTSL 322.52■■□□□ 1.28e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-210ENST00000473331 782 ntTSL 222.4■■□□□ 1.188e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-207ENST00000467820 915 ntTSL 319.93■□□□□ 0.788e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-206ENST00000462780 2420 ntTSL 218.36■□□□□ 0.538e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-208ENST00000468764 682 ntTSL 318.18■□□□□ 0.58e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.368e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-216ENST00000497930 1156 ntTSL 317.25■□□□□ 0.358e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.348e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.348e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.278e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.198e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.118e-10■■■■■ 34.6
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PRPF4O43172 RUSC1-211ENST00000479924 930 ntTSL 314.71□□□□□ -0.058e-10■■■■■ 34.6
PRPF4O43172 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 34.5
PRPF4O43172 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 317.83■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 34.5
PRPF4O43172 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.133e-11■■■■■ 34.5
PRPF4O43172 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.093e-11■■■■■ 34.5
PRPF4O43172 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.963e-11■■■■■ 34.5
PRPF4O43172 PALM-210ENST00000593172 2489 ntTSL 220.9■□□□□ 0.943e-11■■■■■ 34.5
PRPF4O43172 PALM-205ENST00000587513 2290 ntTSL 419.6■□□□□ 0.733e-11■■■■■ 34.5
PRPF4O43172 PALM-211ENST00000633534 879 ntTSL 318.7■□□□□ 0.583e-11■■■■■ 34.5
PRPF4O43172 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-11■■■■■ 34.5
PRPF4O43172 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.043e-11■■■■■ 34.5
PRPF4O43172 CRTC2-201ENST00000303569 2290 ntTSL 523.22■■□□□ 1.311e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.241e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 CRTC2-207ENST00000487235 2263 ntTSL 214.25□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.227e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.227e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 218.42■□□□□ 0.547e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 318.23■□□□□ 0.517e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 514.68□□□□□ -0.067e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.157e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 213.21□□□□□ -0.297e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 48.7□□□□□ -1.023e-12■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 318.55■□□□□ 0.568e-12■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 MAPK8IP3-215ENST00000570131 354 ntTSL 325.97■■□□□ 1.757e-20■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC14.26□□□□□ -0.133e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 GOLGA2P5-203ENST00000397112 2632 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.453e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 GOLGA2P5-204ENST00000421840 2343 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 34.4
PRPF4O43172 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.571e-6■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 GYG2-203ENST00000381161 2852 ntTSL 212.26□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 SLC2A9-207ENST00000505506 567 ntTSL 211.16□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 INTS1-202ENST00000468115 3051 ntTSL 214.97□□□□□ -0.014e-9■■■■■ 34.3
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