RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473331.1

RUSC1-210, Transcript of RUN and SH3 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene RUSC1, Length 782 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-210ENST00000473331 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.45■■■■■ 6.79
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RUSC1-210ENST00000473331 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.2■■■■■ 5.31
RUSC1-210ENST00000473331 NACADO15069 1562 aa48.11■■■■■ 5.29
RUSC1-210ENST00000473331 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.06■■■■■ 5.28
RUSC1-210ENST00000473331 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
RUSC1-210ENST00000473331 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.78■■■■■ 5.24
RUSC1-210ENST00000473331 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.52■■■■■ 5.2
RUSC1-210ENST00000473331 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.04■■■■■ 5.12
RUSC1-210ENST00000473331 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.88■■■■■ 5.1
RUSC1-210ENST00000473331 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.73■■■■■ 5.07
RUSC1-210ENST00000473331 SCRIBQ14160 1630 aa46.65■■■■■ 5.06
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RUSC1-210ENST00000473331 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.37■■■■■ 4.85
RUSC1-210ENST00000473331 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.11■■■■■ 4.81
RUSC1-210ENST00000473331 SMARCA4P51532 1647 aa44.6■■■■■ 4.73
RUSC1-210ENST00000473331 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
RUSC1-210ENST00000473331 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.41■■■■■ 4.7
RUSC1-210ENST00000473331 NCAPD3P42695 1498 aa44.4■■■■■ 4.7
RUSC1-210ENST00000473331 SMARCA2P51531 1590 aa44.35■■■■■ 4.69
RUSC1-210ENST00000473331 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.27■■■■■ 4.68
RUSC1-210ENST00000473331 HMGXB3Q12766 1538 aa44.17■■■■■ 4.66
RUSC1-210ENST00000473331 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.17■■■■■ 4.66
RUSC1-210ENST00000473331 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
RUSC1-210ENST00000473331 WIZO95785 1651 aa43.77■■■■■ 4.6
RUSC1-210ENST00000473331 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
RUSC1-210ENST00000473331 NESP48681 1621 aa43.38■■■■■ 4.54
RUSC1-210ENST00000473331 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
RUSC1-210ENST00000473331 ERCC6Q03468 1493 aa43.28■■■■■ 4.52
RUSC1-210ENST00000473331 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.24■■■■■ 4.51
RUSC1-210ENST00000473331 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.12■■■■■ 4.49
RUSC1-210ENST00000473331 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.98■■■■■ 4.47
RUSC1-210ENST00000473331 CUX2O14529 1486 aa42.87■■■■■ 4.45
RUSC1-210ENST00000473331 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.82■■■■■ 4.45
RUSC1-210ENST00000473331 CFTRP13569 1480 aa42.82■■■■■ 4.45
RUSC1-210ENST00000473331 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.81■■■■■ 4.44
RUSC1-210ENST00000473331 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
RUSC1-210ENST00000473331 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.62■■■■■ 4.41
RUSC1-210ENST00000473331 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.58■■■■■ 4.41
RUSC1-210ENST00000473331 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.55■■■■■ 4.4
RUSC1-210ENST00000473331 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
RUSC1-210ENST00000473331 PRDM2Q13029 1718 aa42.43■■■■■ 4.38
RUSC1-210ENST00000473331 WDR62O43379 1518 aa42.41■■■■■ 4.38
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RUSC1-210ENST00000473331 TOPBP1Q92547 1522 aa41.92■■■■■ 4.3
RUSC1-210ENST00000473331 ABCC8Q09428 1581 aa41.9■■■■■ 4.3
RUSC1-210ENST00000473331 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.85■■■■■ 4.29
RUSC1-210ENST00000473331 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.72■■■■■ 4.27
RUSC1-210ENST00000473331 IFT140Q96RY7 1462 aa41.69■■■■■ 4.26
RUSC1-210ENST00000473331 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
RUSC1-210ENST00000473331 CUX1P39880 1505 aa41.54■■■■■ 4.24
RUSC1-210ENST00000473331 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
RUSC1-210ENST00000473331 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
RUSC1-210ENST00000473331 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.43■■■■■ 4.22
RUSC1-210ENST00000473331 SOGA1O94964 1423 aa41.38■■■■■ 4.22
RUSC1-210ENST00000473331 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.38■■■■■ 4.21
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RUSC1-210ENST00000473331 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
RUSC1-210ENST00000473331 TOP2BQ02880 1626 aa41.14■■■■■ 4.18
RUSC1-210ENST00000473331 SYNJ1O43426 1573 aa41.12■■■■■ 4.17
RUSC1-210ENST00000473331 WDR97A6NE52 1622 aa41.12■■■■■ 4.17
RUSC1-210ENST00000473331 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.12■■■■■ 4.17
RUSC1-210ENST00000473331 OSCARQ8IYS5 282 aa41.06■■■■■ 4.16
RUSC1-210ENST00000473331 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.03■■■■■ 4.16
RUSC1-210ENST00000473331 GRIN2BQ13224 1484 aa40.92■■■■■ 4.14
RUSC1-210ENST00000473331 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.9■■■■■ 4.14
RUSC1-210ENST00000473331 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.89■■■■■ 4.14
RUSC1-210ENST00000473331 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.86■■■■■ 4.13
RUSC1-210ENST00000473331 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
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RUSC1-210ENST00000473331 FBLN2P98095 1184 aa40.8■■■■■ 4.12
RUSC1-210ENST00000473331 PBRM1Q86U86 1689 aa40.78■■■■■ 4.12
RUSC1-210ENST00000473331 SYNJ2O15056 1496 aa40.67■■■■■ 4.1
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RUSC1-210ENST00000473331 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.53■■■■■ 4.08
RUSC1-210ENST00000473331 ADAMTS12P58397 1594 aa40.49■■■■■ 4.07
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RUSC1-210ENST00000473331 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.41■■■■■ 4.06
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RUSC1-210ENST00000473331 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.4■■■■■ 4.06
RUSC1-210ENST00000473331 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.4■■■■■ 4.06
RUSC1-210ENST00000473331 ARHGEF11O15085 1522 aa40.4■■■■■ 4.06
RUSC1-210ENST00000473331 GRIN2AQ12879 1464 aa40.39■■■■■ 4.06
RUSC1-210ENST00000473331 KIF27Q86VH2 1401 aa40.39■■■■■ 4.06
RUSC1-210ENST00000473331 TRIM41Q8WV44 630 aa40.3■■■■■ 4.04
RUSC1-210ENST00000473331 IGF1RP08069 1367 aa40.24■■■■■ 4.03
RUSC1-210ENST00000473331 NUP160Q12769 1436 aa40.23■■■■■ 4.03
RUSC1-210ENST00000473331 CEP170Q5SW79 1584 aa40.18■■■■■ 4.02
RUSC1-210ENST00000473331 CUL7Q14999 1698 aa40.12■■■■■ 4.01
RUSC1-210ENST00000473331 ARAP1Q96P48 1450 aa40.07■■■■■ 4.01
RUSC1-210ENST00000473331 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.04■■■■■ 4
RUSC1-210ENST00000473331 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40■■■■□ 3.99
RUSC1-210ENST00000473331 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.96■■■■□ 3.99
RUSC1-210ENST00000473331 SHROOM2Q13796 1616 aa39.91■■■■□ 3.98
RUSC1-210ENST00000473331 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.83■■■■□ 3.97
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