RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492536.5

RUSC1-215, Transcript of RUN and SH3 domain containing 1, human

TSL 3

Gene RUSC1, Length 1,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUSC1-215	ENST00000492536	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.68	■■■■■ 6.98
RUSC1-215	ENST00000492536	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.55	■■■■■ 6
RUSC1-215	ENST00000492536	ABCC9	O60706	1549 aa		52.14	■■■■■ 5.94
RUSC1-215	ENST00000492536	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		49.86	■■■■■ 5.57
RUSC1-215	ENST00000492536	NACAD	O15069	1562 aa		49.62	■■■■■ 5.53
RUSC1-215	ENST00000492536	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.3	■■■■■ 5.48
RUSC1-215	ENST00000492536	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.1	■■■■■ 5.45
RUSC1-215	ENST00000492536	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.73	■■■■■ 5.39
RUSC1-215	ENST00000492536	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.61	■■■■■ 5.37
RUSC1-215	ENST00000492536	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.57	■■■■■ 5.37
RUSC1-215	ENST00000492536	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	48.56	■■■■■ 5.36
RUSC1-215	ENST00000492536	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		48.55	■■■■■ 5.36
RUSC1-215	ENST00000492536	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.32	■■■■■ 5.33
RUSC1-215	ENST00000492536	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.88	■■■■■ 5.26
RUSC1-215	ENST00000492536	SCRIB	Q14160	1630 aa		47.81	■■■■■ 5.24
RUSC1-215	ENST00000492536	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	47.15	■■■■■ 5.14
RUSC1-215	ENST00000492536	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		47.13	■■■■■ 5.14
RUSC1-215	ENST00000492536	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		46.97	■■■■■ 5.11
RUSC1-215	ENST00000492536	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.8	■■■■■ 4.92
RUSC1-215	ENST00000492536	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.69	■■■■■ 4.9
RUSC1-215	ENST00000492536	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.68	■■■■■ 4.9
RUSC1-215	ENST00000492536	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.6	■■■■■ 4.89
RUSC1-215	ENST00000492536	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.57	■■■■■ 4.89
RUSC1-215	ENST00000492536	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.5	■■■■■ 4.87
RUSC1-215	ENST00000492536	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.31	■■■■■ 4.84
RUSC1-215	ENST00000492536	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.25	■■■■■ 4.83
RUSC1-215	ENST00000492536	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.17	■■■■■ 4.82
RUSC1-215	ENST00000492536	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.04	■■■■■ 4.8
RUSC1-215	ENST00000492536	CUX2	O14529	1486 aa		44.9	■■■■■ 4.78
RUSC1-215	ENST00000492536	NES	P48681	1621 aa		44.86	■■■■■ 4.77
RUSC1-215	ENST00000492536	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.71	■■■■■ 4.75
RUSC1-215	ENST00000492536	WIZ	O95785	1651 aa		44.62	■■■■■ 4.73
RUSC1-215	ENST00000492536	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.45	■■■■■ 4.71
RUSC1-215	ENST00000492536	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.44	■■■■■ 4.7
RUSC1-215	ENST00000492536	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.41	■■■■■ 4.7
RUSC1-215	ENST00000492536	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	44.39	■■■■■ 4.7
RUSC1-215	ENST00000492536	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.39	■■■■■ 4.7
RUSC1-215	ENST00000492536	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.29	■■■■■ 4.68
RUSC1-215	ENST00000492536	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.17	■■■■■ 4.66
RUSC1-215	ENST00000492536	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.02	■■■■■ 4.64
RUSC1-215	ENST00000492536	CFTR	P13569	1480 aa		43.97	■■■■■ 4.63
RUSC1-215	ENST00000492536	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.92	■■■■■ 4.62
RUSC1-215	ENST00000492536	WDR62	O43379	1518 aa		43.9	■■■■■ 4.62
RUSC1-215	ENST00000492536	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.89	■■■■■ 4.62
RUSC1-215	ENST00000492536	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.63	■■■■■ 4.57
RUSC1-215	ENST00000492536	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.53	■■■■■ 4.56
RUSC1-215	ENST00000492536	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
RUSC1-215	ENST00000492536	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.1	■■■■■ 4.49
RUSC1-215	ENST00000492536	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.08	■■■■■ 4.49
RUSC1-215	ENST00000492536	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.04	■■■■■ 4.48
RUSC1-215	ENST00000492536	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.97	■■■■■ 4.47
RUSC1-215	ENST00000492536	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		42.87	■■■■■ 4.45
RUSC1-215	ENST00000492536	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
RUSC1-215	ENST00000492536	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
RUSC1-215	ENST00000492536	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
RUSC1-215	ENST00000492536	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42
RUSC1-215	ENST00000492536	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
RUSC1-215	ENST00000492536	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.56	■■■■■ 4.4
RUSC1-215	ENST00000492536	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.51	■■■■■ 4.4	8e-10	■■■■■ 51.9
RUSC1-215	ENST00000492536	SOGA1	O94964	1423 aa		42.48	■■■■■ 4.39
RUSC1-215	ENST00000492536	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.45	■■■■■ 4.39
RUSC1-215	ENST00000492536	CUX1	P39880	1505 aa		42.44	■■■■■ 4.38
RUSC1-215	ENST00000492536	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.43	■■■■■ 4.38
RUSC1-215	ENST00000492536	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.36	■■■■■ 4.37
RUSC1-215	ENST00000492536	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
RUSC1-215	ENST00000492536	CHD1	O14646	1710 aa		42.24	■■■■■ 4.35
RUSC1-215	ENST00000492536	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.22	■■■■■ 4.35
RUSC1-215	ENST00000492536	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.22	■■■■■ 4.35
RUSC1-215	ENST00000492536	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.22	■■■■■ 4.35
RUSC1-215	ENST00000492536	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.16	■■■■■ 4.34
RUSC1-215	ENST00000492536	FBLN2	P98095	1184 aa		42.16	■■■■■ 4.34
RUSC1-215	ENST00000492536	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.12	■■■■■ 4.33
RUSC1-215	ENST00000492536	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.1	■■■■■ 4.33
RUSC1-215	ENST00000492536	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.09	■■■■■ 4.33
RUSC1-215	ENST00000492536	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.01	■■■■■ 4.32
RUSC1-215	ENST00000492536	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.98	■■■■■ 4.31
RUSC1-215	ENST00000492536	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.96	■■■■■ 4.31
RUSC1-215	ENST00000492536	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.92	■■■■■ 4.3
RUSC1-215	ENST00000492536	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.92	■■■■■ 4.3
RUSC1-215	ENST00000492536	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.9	■■■■■ 4.3
RUSC1-215	ENST00000492536	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.9	■■■■■ 4.3
RUSC1-215	ENST00000492536	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.87	■■■■■ 4.29
RUSC1-215	ENST00000492536	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.87	■■■■■ 4.29
RUSC1-215	ENST00000492536	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.87	■■■■■ 4.29
RUSC1-215	ENST00000492536	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.83	■■■■■ 4.29
RUSC1-215	ENST00000492536	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		41.79	■■■■■ 4.28
RUSC1-215	ENST00000492536	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.75	■■■■■ 4.27
RUSC1-215	ENST00000492536	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.55	■■■■■ 4.24
RUSC1-215	ENST00000492536	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.54	■■■■■ 4.24
RUSC1-215	ENST00000492536	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.51	■■■■■ 4.24
RUSC1-215	ENST00000492536	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.49	■■■■■ 4.23
RUSC1-215	ENST00000492536	NUP160	Q12769	1436 aa		41.41	■■■■■ 4.22
RUSC1-215	ENST00000492536	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.34	■■■■■ 4.21
RUSC1-215	ENST00000492536	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	41.22	■■■■■ 4.19
RUSC1-215	ENST00000492536	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.16	■■■■■ 4.18
RUSC1-215	ENST00000492536	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.12	■■■■■ 4.17
RUSC1-215	ENST00000492536	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.1	■■■■■ 4.17
RUSC1-215	ENST00000492536	IGF1R	P08069	1367 aa		41	■■■■■ 4.15
RUSC1-215	ENST00000492536	JPH4	Q96JJ6	628 aa		40.96	■■■■■ 4.15
RUSC1-215	ENST00000492536	CUL7	Q14999	1698 aa		40.96	■■■■■ 4.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.5 ms