Protein–RNA interactions for Protein: O14770

MEIS2, Homeobox protein Meis2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS2O14770 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MEIS2O14770 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEIS2O14770 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS2O14770 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MEIS2O14770 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MEIS2O14770 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS2O14770 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms