Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM229AB2RXF0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM229AB2RXF0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM229AB2RXF0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM229AB2RXF0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms