Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0J9YY10 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0J9YY10 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0J9YY10 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0J9YY10 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0J9YY10 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms