Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms