RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292494.10

LY6E-201, Transcript of lymphocyte antigen 6 family member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene LY6E, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6E-201ENST00000292494 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.84■■■■■ 6.21
LY6E-201ENST00000292494 ABCC9O60706 1549 aa48.36■■■■■ 5.33
LY6E-201ENST00000292494 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.33■■■■■ 5.33
LY6E-201ENST00000292494 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.97■■■■■ 4.95
LY6E-201ENST00000292494 NACADO15069 1562 aa45.63■■■■■ 4.9
LY6E-201ENST00000292494 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.41■■■■■ 4.86
LY6E-201ENST00000292494 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.3■■■■■ 4.84
LY6E-201ENST00000292494 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.05■■■■■ 4.8
LY6E-201ENST00000292494 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45■■■■■ 4.79
LY6E-201ENST00000292494 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.96■■■■■ 4.79
LY6E-201ENST00000292494 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.7■■■■■ 4.75
LY6E-201ENST00000292494 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.66■■■■■ 4.74
LY6E-201ENST00000292494 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.42■■■■■ 4.7
LY6E-201ENST00000292494 SCRIBQ14160 1630 aa44.13■■■■■ 4.66
LY6E-201ENST00000292494 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.98■■■■■ 4.63
LY6E-201ENST00000292494 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.68■■■■■ 4.58
LY6E-201ENST00000292494 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
LY6E-201ENST00000292494 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.52■■■■■ 4.56
LY6E-201ENST00000292494 NCAPD3P42695 1498 aa42.11■■■■■ 4.33
LY6E-201ENST00000292494 SMARCA4P51532 1647 aa42.06■■■■■ 4.32
LY6E-201ENST00000292494 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.04■■■■■ 4.32
LY6E-201ENST00000292494 SMARCA2P51531 1590 aa41.91■■■■■ 4.3
LY6E-201ENST00000292494 HMGXB3Q12766 1538 aa41.86■■■■■ 4.29
LY6E-201ENST00000292494 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
LY6E-201ENST00000292494 ERCC6Q03468 1493 aa41.72■■■■■ 4.27
LY6E-201ENST00000292494 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
LY6E-201ENST00000292494 CUX2O14529 1486 aa41.6■■■■■ 4.25
LY6E-201ENST00000292494 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.59■■■■■ 4.25
LY6E-201ENST00000292494 NESP48681 1621 aa41.58■■■■■ 4.25
LY6E-201ENST00000292494 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.54■■■■■ 4.24
LY6E-201ENST00000292494 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.49■■■■■ 4.23
LY6E-201ENST00000292494 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.2■■■■■ 4.19
LY6E-201ENST00000292494 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
LY6E-201ENST00000292494 WIZO95785 1651 aa41.07■■■■■ 4.17
LY6E-201ENST00000292494 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.07■■■■■ 4.16
LY6E-201ENST00000292494 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.91■■■■■ 4.14
LY6E-201ENST00000292494 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.84■■■■■ 4.13
LY6E-201ENST00000292494 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
LY6E-201ENST00000292494 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.64■■■■■ 4.1
LY6E-201ENST00000292494 WDR62O43379 1518 aa40.56■■■■■ 4.08
LY6E-201ENST00000292494 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
LY6E-201ENST00000292494 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.47■■■■■ 4.07
LY6E-201ENST00000292494 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.44■■■■■ 4.06
LY6E-201ENST00000292494 CFTRP13569 1480 aa40.4■■■■■ 4.06
LY6E-201ENST00000292494 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
LY6E-201ENST00000292494 PRDM2Q13029 1718 aa40.08■■■■■ 4.01
LY6E-201ENST00000292494 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.03■■■■■ 4
LY6E-201ENST00000292494 TRIM41Q8WV44 630 aa39.78■■■■□ 3.96
LY6E-201ENST00000292494 TOPBP1Q92547 1522 aa39.68■■■■□ 3.94
LY6E-201ENST00000292494 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
LY6E-201ENST00000292494 IFT140Q96RY7 1462 aa39.63■■■■□ 3.94
LY6E-201ENST00000292494 OSCARQ8IYS5 282 aa39.62■■■■□ 3.93
LY6E-201ENST00000292494 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.54■■■■□ 3.92
LY6E-201ENST00000292494 ABCC8Q09428 1581 aa39.47■■■■□ 3.91
LY6E-201ENST00000292494 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
LY6E-201ENST00000292494 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
LY6E-201ENST00000292494 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
LY6E-201ENST00000292494 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.26■■■■□ 3.88
LY6E-201ENST00000292494 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.26■■■■□ 3.88
LY6E-201ENST00000292494 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.26■■■■□ 3.88
LY6E-201ENST00000292494 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.25■■■■□ 3.873e-7■■■■■ 30.5
LY6E-201ENST00000292494 CHD1O14646 1710 aa39.17■■■■□ 3.86
LY6E-201ENST00000292494 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.16■■■■□ 3.86
LY6E-201ENST00000292494 ARHGEF11O15085 1522 aa39.12■■■■□ 3.85
LY6E-201ENST00000292494 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.05■■■■□ 3.84
LY6E-201ENST00000292494 SOGA1O94964 1423 aa39.04■■■■□ 3.84
LY6E-201ENST00000292494 CUX1P39880 1505 aa39.04■■■■□ 3.84
LY6E-201ENST00000292494 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
LY6E-201ENST00000292494 FBLN2P98095 1184 aa38.96■■■■□ 3.83
LY6E-201ENST00000292494 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.88■■■■□ 3.81
LY6E-201ENST00000292494 WDR97A6NE52 1622 aa38.87■■■■□ 3.81
LY6E-201ENST00000292494 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
LY6E-201ENST00000292494 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.76■■■■□ 3.8
LY6E-201ENST00000292494 ARAP1Q96P48 1450 aa38.75■■■■□ 3.79
LY6E-201ENST00000292494 GRIN2BQ13224 1484 aa38.72■■■■□ 3.79
LY6E-201ENST00000292494 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
LY6E-201ENST00000292494 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.68■■■■□ 3.78
LY6E-201ENST00000292494 PBRM1Q86U86 1689 aa38.67■■■■□ 3.78
LY6E-201ENST00000292494 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
LY6E-201ENST00000292494 SYNJ1O43426 1573 aa38.61■■■■□ 3.77
LY6E-201ENST00000292494 SYNJ2O15056 1496 aa38.6■■■■□ 3.77
LY6E-201ENST00000292494 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.6■■■■□ 3.77
LY6E-201ENST00000292494 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.57■■■■□ 3.77
LY6E-201ENST00000292494 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.56■■■■□ 3.76
LY6E-201ENST00000292494 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.41■■■■□ 3.74
LY6E-201ENST00000292494 TOP2BQ02880 1626 aa38.39■■■■□ 3.74
LY6E-201ENST00000292494 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.38■■■■□ 3.74
LY6E-201ENST00000292494 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.72
LY6E-201ENST00000292494 ADAMTS12P58397 1594 aa38.29■■■■□ 3.72
LY6E-201ENST00000292494 GRIN2AQ12879 1464 aa38.26■■■■□ 3.72
LY6E-201ENST00000292494 CEP170Q5SW79 1584 aa38.17■■■■□ 3.7
LY6E-201ENST00000292494 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.14■■■■□ 3.7
LY6E-201ENST00000292494 NUP160Q12769 1436 aa38.11■■■■□ 3.69
LY6E-201ENST00000292494 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.08■■■■□ 3.69
LY6E-201ENST00000292494 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.07■■■■□ 3.68
LY6E-201ENST00000292494 SHROOM2Q13796 1616 aa37.98■■■■□ 3.67
LY6E-201ENST00000292494 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.77■■■■□ 3.64
LY6E-201ENST00000292494 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
LY6E-201ENST00000292494 JPH4Q96JJ6 628 aa37.63■■■■□ 3.61
LY6E-201ENST00000292494 KIF27Q86VH2 1401 aa37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms