RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287667.11

NOMO1-201, Transcript of NODAL modulator 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO1, Length 4,355 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO1-201ENST00000287667 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.15■■■□□ 2.74
NOMO1-201ENST00000287667 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.82■■■□□ 2.69
NOMO1-201ENST00000287667 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
NOMO1-201ENST00000287667 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.79■■■□□ 2.52
NOMO1-201ENST00000287667 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.81■■■□□ 2.36
NOMO1-201ENST00000287667 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.5■■■□□ 2.31
NOMO1-201ENST00000287667 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
NOMO1-201ENST00000287667 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
NOMO1-201ENST00000287667 TRIM41Q8WV44 630 aa28.66■■■□□ 2.18
NOMO1-201ENST00000287667 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.43■■■□□ 2.14
NOMO1-201ENST00000287667 APLP2Q06481 763 aa28.41■■■□□ 2.14
NOMO1-201ENST00000287667 HRCP23327 699 aa28.41■■■□□ 2.14
NOMO1-201ENST00000287667 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.38■■■□□ 2.13
NOMO1-201ENST00000287667 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
NOMO1-201ENST00000287667 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
NOMO1-201ENST00000287667 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
NOMO1-201ENST00000287667 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
NOMO1-201ENST00000287667 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
NOMO1-201ENST00000287667 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
NOMO1-201ENST00000287667 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
NOMO1-201ENST00000287667 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
NOMO1-201ENST00000287667 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
NOMO1-201ENST00000287667 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
NOMO1-201ENST00000287667 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
NOMO1-201ENST00000287667 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
NOMO1-201ENST00000287667 MYT1Q01538 1121 aa27.32■■□□□ 1.96
NOMO1-201ENST00000287667 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.22■■□□□ 1.95
NOMO1-201ENST00000287667 ITGAEP38570 1179 aa27.2■■□□□ 1.94
NOMO1-201ENST00000287667 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
NOMO1-201ENST00000287667 NEFLP07196 543 aa26.99■■□□□ 1.91
NOMO1-201ENST00000287667 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.9■■□□□ 1.9
NOMO1-201ENST00000287667 ABCC9O60706 1549 aa26.86■■□□□ 1.89
NOMO1-201ENST00000287667 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
NOMO1-201ENST00000287667 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
NOMO1-201ENST00000287667 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.69■■□□□ 1.86
NOMO1-201ENST00000287667 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.58■■□□□ 1.85
NOMO1-201ENST00000287667 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
NOMO1-201ENST00000287667 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
NOMO1-201ENST00000287667 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
NOMO1-201ENST00000287667 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.48■■□□□ 1.83
NOMO1-201ENST00000287667 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.47■■□□□ 1.83
NOMO1-201ENST00000287667 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
NOMO1-201ENST00000287667 BCANQ96GW7 911 aa26.42■■□□□ 1.82
NOMO1-201ENST00000287667 NEUROD1Q13562 356 aa26.38■■□□□ 1.81
NOMO1-201ENST00000287667 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
NOMO1-201ENST00000287667 SCRIBQ14160 1630 aa26.28■■□□□ 1.8
NOMO1-201ENST00000287667 P3H3Q8IVL6 736 aa26.07■■□□□ 1.76
NOMO1-201ENST00000287667 TRIM52Q96A61 297 aa26.05■■□□□ 1.76
NOMO1-201ENST00000287667 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
NOMO1-201ENST00000287667 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.97■■□□□ 1.75
NOMO1-201ENST00000287667 ANP32CO43423 234 aa25.97■■□□□ 1.75
NOMO1-201ENST00000287667 MIER1Q8N108 512 aa25.87■■□□□ 1.73
NOMO1-201ENST00000287667 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.83■■□□□ 1.72
NOMO1-201ENST00000287667 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
NOMO1-201ENST00000287667 ARID3CA6NKF2 412 aa25.78■■□□□ 1.72
NOMO1-201ENST00000287667 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
NOMO1-201ENST00000287667 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
NOMO1-201ENST00000287667 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
NOMO1-201ENST00000287667 FKBP8Q14318 412 aa25.68■■□□□ 1.7
NOMO1-201ENST00000287667 CEP162Q5TB80 1403 aa25.65■■□□□ 1.7
NOMO1-201ENST00000287667 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
NOMO1-201ENST00000287667 CLIP1P30622 1438 aa25.6■■□□□ 1.69
NOMO1-201ENST00000287667 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
NOMO1-201ENST00000287667 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
NOMO1-201ENST00000287667 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.48■■□□□ 1.67
NOMO1-201ENST00000287667 FBLN2P98095 1184 aa25.48■■□□□ 1.67
NOMO1-201ENST00000287667 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
NOMO1-201ENST00000287667 TONSLQ96HA7 1378 aa25.47■■□□□ 1.67
NOMO1-201ENST00000287667 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.45■■□□□ 1.67
NOMO1-201ENST00000287667 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.39■■□□□ 1.65
NOMO1-201ENST00000287667 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.38■■□□□ 1.65
NOMO1-201ENST00000287667 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NOMO1-201ENST00000287667 GOLGA3Q08378 1498 aa25.37■■□□□ 1.65
NOMO1-201ENST00000287667 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.35■■□□□ 1.65
NOMO1-201ENST00000287667 EEA1Q15075 1411 aa25.33■■□□□ 1.65
NOMO1-201ENST00000287667 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.33■■□□□ 1.65
NOMO1-201ENST00000287667 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.64
NOMO1-201ENST00000287667 SOGA1O94964 1423 aa25.27■■□□□ 1.64
NOMO1-201ENST00000287667 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NOMO1-201ENST00000287667 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NOMO1-201ENST00000287667 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NOMO1-201ENST00000287667 NBR1Q14596 966 aa25.15■■□□□ 1.62
NOMO1-201ENST00000287667 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.12■■□□□ 1.61
NOMO1-201ENST00000287667 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.12■■□□□ 1.61
NOMO1-201ENST00000287667 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.11■■□□□ 1.61
NOMO1-201ENST00000287667 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.11■■□□□ 1.61
NOMO1-201ENST00000287667 MRS2Q9HD23 443 aa25.11■■□□□ 1.61
NOMO1-201ENST00000287667 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
NOMO1-201ENST00000287667 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.1■■□□□ 1.61
NOMO1-201ENST00000287667 NACADO15069 1562 aa25.09■■□□□ 1.61
NOMO1-201ENST00000287667 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
NOMO1-201ENST00000287667 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.04■■□□□ 1.6
NOMO1-201ENST00000287667 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.03■■□□□ 1.6
NOMO1-201ENST00000287667 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
NOMO1-201ENST00000287667 ABCC8Q09428 1581 aa25.02■■□□□ 1.6
NOMO1-201ENST00000287667 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.01■■□□□ 1.59
NOMO1-201ENST00000287667 TMC1Q8TDI8 760 aa24.98■■□□□ 1.59
NOMO1-201ENST00000287667 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
NOMO1-201ENST00000287667 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.97■■□□□ 1.59
NOMO1-201ENST00000287667 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms