Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms