RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RALGPS1-204ENST00000373436 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.72■■■■□ 3.79
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RALGPS1-204ENST00000373436 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.94■■■■□ 3.66
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RALGPS1-204ENST00000373436 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.97■■■■□ 3.35
RALGPS1-204ENST00000373436 SMARCA2P51531 1590 aa35.96■■■■□ 3.35
RALGPS1-204ENST00000373436 WIZO95785 1651 aa35.95■■■■□ 3.35
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RALGPS1-204ENST00000373436 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.79■■■■□ 3.16
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RALGPS1-204ENST00000373436 PRDM2Q13029 1718 aa34.62■■■■□ 3.13
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RALGPS1-204ENST00000373436 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.45■■■■□ 3.1
RALGPS1-204ENST00000373436 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.43■■■■□ 3.1
RALGPS1-204ENST00000373436 ERCC6Q03468 1493 aa34.38■■■■□ 3.09
RALGPS1-204ENST00000373436 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.33■■■■□ 3.09
RALGPS1-204ENST00000373436 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.13■■■■□ 3.05
RALGPS1-204ENST00000373436 ABCC8Q09428 1581 aa34.12■■■■□ 3.05
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RALGPS1-204ENST00000373436 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34■■■■□ 3.03
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RALGPS1-204ENST00000373436 TOPBP1Q92547 1522 aa33.98■■■■□ 3.03
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RALGPS1-204ENST00000373436 SOGA1O94964 1423 aa33.6■■■□□ 2.97
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RALGPS1-204ENST00000373436 WDR97A6NE52 1622 aa33.47■■■□□ 2.95
RALGPS1-204ENST00000373436 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.46■■■□□ 2.95
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RALGPS1-204ENST00000373436 KIF27Q86VH2 1401 aa33.24■■■□□ 2.91
RALGPS1-204ENST00000373436 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.23■■■□□ 2.91
RALGPS1-204ENST00000373436 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.2■■■□□ 2.91
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RALGPS1-204ENST00000373436 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.56■■■□□ 2.8
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RALGPS1-204ENST00000373436 OSCARQ8IYS5 282 aa32.47■■■□□ 2.79
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