RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.34■■■□□ 2.61
NOMO3-201ENST00000263012 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.56■■■□□ 2.48
NOMO3-201ENST00000263012 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
NOMO3-201ENST00000263012 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.24■■■□□ 2.43
NOMO3-201ENST00000263012 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.42■■■□□ 2.3
NOMO3-201ENST00000263012 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.24■■■□□ 2.27
NOMO3-201ENST00000263012 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
NOMO3-201ENST00000263012 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
NOMO3-201ENST00000263012 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
NOMO3-201ENST00000263012 HRCP23327 699 aa28.25■■■□□ 2.11
NOMO3-201ENST00000263012 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.23■■■□□ 2.11
NOMO3-201ENST00000263012 CHIC1Q5VXU3 224 aa28■■■□□ 2.07
NOMO3-201ENST00000263012 TRIM41Q8WV44 630 aa27.7■■■□□ 2.02
NOMO3-201ENST00000263012 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
NOMO3-201ENST00000263012 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
NOMO3-201ENST00000263012 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
NOMO3-201ENST00000263012 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
NOMO3-201ENST00000263012 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
NOMO3-201ENST00000263012 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
NOMO3-201ENST00000263012 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
NOMO3-201ENST00000263012 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
NOMO3-201ENST00000263012 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NOMO3-201ENST00000263012 APLP2Q06481 763 aa26.93■■□□□ 1.9
NOMO3-201ENST00000263012 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.93■■□□□ 1.9
NOMO3-201ENST00000263012 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
NOMO3-201ENST00000263012 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.69■■□□□ 1.86
NOMO3-201ENST00000263012 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
NOMO3-201ENST00000263012 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
NOMO3-201ENST00000263012 ITGAEP38570 1179 aa26.48■■□□□ 1.83
NOMO3-201ENST00000263012 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
NOMO3-201ENST00000263012 NEUROD1Q13562 356 aa26.35■■□□□ 1.81
NOMO3-201ENST00000263012 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
NOMO3-201ENST00000263012 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
NOMO3-201ENST00000263012 BCANQ96GW7 911 aa26.11■■□□□ 1.77
NOMO3-201ENST00000263012 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.07■■□□□ 1.76
NOMO3-201ENST00000263012 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
NOMO3-201ENST00000263012 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.93■■□□□ 1.74
NOMO3-201ENST00000263012 NEFLP07196 543 aa25.88■■□□□ 1.73
NOMO3-201ENST00000263012 MYT1Q01538 1121 aa25.84■■□□□ 1.73
NOMO3-201ENST00000263012 ABCC9O60706 1549 aa25.8■■□□□ 1.72
NOMO3-201ENST00000263012 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
NOMO3-201ENST00000263012 MIER1Q8N108 512 aa25.74■■□□□ 1.71
NOMO3-201ENST00000263012 SCRIBQ14160 1630 aa25.6■■□□□ 1.69
NOMO3-201ENST00000263012 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.6■■□□□ 1.69
NOMO3-201ENST00000263012 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.56■■□□□ 1.68
NOMO3-201ENST00000263012 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
NOMO3-201ENST00000263012 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
NOMO3-201ENST00000263012 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
NOMO3-201ENST00000263012 P3H3Q8IVL6 736 aa25.33■■□□□ 1.65
NOMO3-201ENST00000263012 FKBP8Q14318 412 aa25.3■■□□□ 1.64
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.29■■□□□ 1.64
NOMO3-201ENST00000263012 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NOMO3-201ENST00000263012 TRIM52Q96A61 297 aa25.26■■□□□ 1.63
NOMO3-201ENST00000263012 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.13■■□□□ 1.61
NOMO3-201ENST00000263012 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NOMO3-201ENST00000263012 ARID3CA6NKF2 412 aa25.08■■□□□ 1.61
NOMO3-201ENST00000263012 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.05■■□□□ 1.6
NOMO3-201ENST00000263012 ANP32CO43423 234 aa25.05■■□□□ 1.6
NOMO3-201ENST00000263012 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.03■■□□□ 1.6
NOMO3-201ENST00000263012 CEP162Q5TB80 1403 aa25.03■■□□□ 1.6
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
NOMO3-201ENST00000263012 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
NOMO3-201ENST00000263012 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
NOMO3-201ENST00000263012 SOGA1O94964 1423 aa24.86■■□□□ 1.57
NOMO3-201ENST00000263012 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NOMO3-201ENST00000263012 CLIP1P30622 1438 aa24.78■■□□□ 1.56
NOMO3-201ENST00000263012 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.77■■□□□ 1.56
NOMO3-201ENST00000263012 KCNH8Q96L42 1107 aa24.77■■□□□ 1.56
NOMO3-201ENST00000263012 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.76■■□□□ 1.55
NOMO3-201ENST00000263012 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.73■■□□□ 1.55
NOMO3-201ENST00000263012 NBR1Q14596 966 aa24.69■■□□□ 1.54
NOMO3-201ENST00000263012 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NOMO3-201ENST00000263012 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NOMO3-201ENST00000263012 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.67■■□□□ 1.54
NOMO3-201ENST00000263012 ABCC8Q09428 1581 aa24.67■■□□□ 1.54
NOMO3-201ENST00000263012 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.63■■□□□ 1.53
NOMO3-201ENST00000263012 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.61■■□□□ 1.53
NOMO3-201ENST00000263012 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.59■■□□□ 1.53
NOMO3-201ENST00000263012 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
NOMO3-201ENST00000263012 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
NOMO3-201ENST00000263012 TONSLQ96HA7 1378 aa24.51■■□□□ 1.51
NOMO3-201ENST00000263012 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.51■■□□□ 1.51
NOMO3-201ENST00000263012 WIZO95785 1651 aa24.49■■□□□ 1.51
NOMO3-201ENST00000263012 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.49■■□□□ 1.51
NOMO3-201ENST00000263012 GOLGA3Q08378 1498 aa24.46■■□□□ 1.51
NOMO3-201ENST00000263012 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
NOMO3-201ENST00000263012 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.39■■□□□ 1.5
NOMO3-201ENST00000263012 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.39■■□□□ 1.49
NOMO3-201ENST00000263012 MRS2Q9HD23 443 aa24.38■■□□□ 1.49
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NOMO3-201ENST00000263012 BCL11AQ9H165 835 aa24.36■■□□□ 1.49
NOMO3-201ENST00000263012 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NOMO3-201ENST00000263012 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.34■■□□□ 1.49
NOMO3-201ENST00000263012 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NOMO3-201ENST00000263012 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.3■■□□□ 1.48
NOMO3-201ENST00000263012 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NOMO3-201ENST00000263012 FBLN2P98095 1184 aa24.25■■□□□ 1.47
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.25■■□□□ 1.47
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