RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.7■■■■■ 4.27
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.1■■■■□ 3.37
GDPD1-201ENST00000284116 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
GDPD1-201ENST00000284116 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.44■■■■□ 3.1
GDPD1-201ENST00000284116 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.42■■■■□ 3.1
GDPD1-201ENST00000284116 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.37■■■■□ 3.09
GDPD1-201ENST00000284116 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.85■■■■□ 3.01
GDPD1-201ENST00000284116 ABCC9O60706 1549 aa33.78■■■■□ 3
GDPD1-201ENST00000284116 NACADO15069 1562 aa33.53■■■□□ 2.96
GDPD1-201ENST00000284116 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
GDPD1-201ENST00000284116 SCRIBQ14160 1630 aa33.31■■■□□ 2.92
GDPD1-201ENST00000284116 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.12■■■□□ 2.89
GDPD1-201ENST00000284116 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
GDPD1-201ENST00000284116 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.55■■■□□ 2.8
GDPD1-201ENST00000284116 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.41■■■□□ 2.78
GDPD1-201ENST00000284116 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.27■■■□□ 2.76
GDPD1-201ENST00000284116 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.19■■■□□ 2.74
GDPD1-201ENST00000284116 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.16■■■□□ 2.74
GDPD1-201ENST00000284116 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
GDPD1-201ENST00000284116 WIZO95785 1651 aa32.05■■■□□ 2.72
GDPD1-201ENST00000284116 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32■■■□□ 2.71
GDPD1-201ENST00000284116 SMARCA4P51532 1647 aa31.95■■■□□ 2.71
GDPD1-201ENST00000284116 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
GDPD1-201ENST00000284116 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.52■■■□□ 2.64
GDPD1-201ENST00000284116 SMARCA2P51531 1590 aa31.41■■■□□ 2.62
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.4■■■□□ 2.62
GDPD1-201ENST00000284116 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM41Q8WV44 630 aa31.32■■■□□ 2.6
GDPD1-201ENST00000284116 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.32■■■□□ 2.6
GDPD1-201ENST00000284116 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
GDPD1-201ENST00000284116 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.03■■■□□ 2.56
GDPD1-201ENST00000284116 NCAPD3P42695 1498 aa30.96■■■□□ 2.55
GDPD1-201ENST00000284116 HMGXB3Q12766 1538 aa30.92■■■□□ 2.54
GDPD1-201ENST00000284116 ABCC8Q09428 1581 aa30.89■■■□□ 2.54
GDPD1-201ENST00000284116 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
GDPD1-201ENST00000284116 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.61■■■□□ 2.49
GDPD1-201ENST00000284116 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.57■■■□□ 2.48
GDPD1-201ENST00000284116 SYNJ1O43426 1573 aa30.48■■■□□ 2.47
GDPD1-201ENST00000284116 SOGA1O94964 1423 aa30.42■■■□□ 2.46
GDPD1-201ENST00000284116 CFTRP13569 1480 aa30.41■■■□□ 2.46
GDPD1-201ENST00000284116 EEA1Q15075 1411 aa30.4■■■□□ 2.46
GDPD1-201ENST00000284116 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.36■■■□□ 2.45
GDPD1-201ENST00000284116 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.31■■■□□ 2.44
GDPD1-201ENST00000284116 TOP2BQ02880 1626 aa30.3■■■□□ 2.44
GDPD1-201ENST00000284116 PRDM2Q13029 1718 aa30.28■■■□□ 2.44
GDPD1-201ENST00000284116 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.27■■■□□ 2.44
GDPD1-201ENST00000284116 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.26■■■□□ 2.44
GDPD1-201ENST00000284116 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.21■■■□□ 2.43
GDPD1-201ENST00000284116 CUX1P39880 1505 aa30.12■■■□□ 2.41
GDPD1-201ENST00000284116 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.08■■■□□ 2.41
GDPD1-201ENST00000284116 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.05■■■□□ 2.4
GDPD1-201ENST00000284116 GOLGA3Q08378 1498 aa30.02■■■□□ 2.4
GDPD1-201ENST00000284116 KIF21BO75037 1637 aa30■■■□□ 2.39
GDPD1-201ENST00000284116 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.97■■■□□ 2.39
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
GDPD1-201ENST00000284116 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
GDPD1-201ENST00000284116 CEP162Q5TB80 1403 aa29.9■■■□□ 2.38
GDPD1-201ENST00000284116 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.88■■■□□ 2.37
GDPD1-201ENST00000284116 NESP48681 1621 aa29.83■■■□□ 2.37
GDPD1-201ENST00000284116 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.81■■■□□ 2.36
GDPD1-201ENST00000284116 KIF27Q86VH2 1401 aa29.79■■■□□ 2.36
GDPD1-201ENST00000284116 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.76■■■□□ 2.35
GDPD1-201ENST00000284116 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.73■■■□□ 2.35
GDPD1-201ENST00000284116 PRXQ9BXM0 1461 aa29.72■■■□□ 2.35
GDPD1-201ENST00000284116 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.71■■■□□ 2.35
GDPD1-201ENST00000284116 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.7■■■□□ 2.34
GDPD1-201ENST00000284116 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.68■■■□□ 2.34
GDPD1-201ENST00000284116 CUX2O14529 1486 aa29.62■■■□□ 2.33
GDPD1-201ENST00000284116 TOPBP1Q92547 1522 aa29.61■■■□□ 2.33
GDPD1-201ENST00000284116 HRCP23327 699 aa29.6■■■□□ 2.33
GDPD1-201ENST00000284116 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.57■■■□□ 2.32
GDPD1-201ENST00000284116 CLIP1P30622 1438 aa29.57■■■□□ 2.32
GDPD1-201ENST00000284116 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
GDPD1-201ENST00000284116 IGF1RP08069 1367 aa29.51■■■□□ 2.32
GDPD1-201ENST00000284116 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
GDPD1-201ENST00000284116 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
GDPD1-201ENST00000284116 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.45■■■□□ 2.31
GDPD1-201ENST00000284116 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.45■■■□□ 2.31
GDPD1-201ENST00000284116 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.44■■■□□ 2.3
GDPD1-201ENST00000284116 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.37■■■□□ 2.29
GDPD1-201ENST00000284116 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.37■■■□□ 2.29
GDPD1-201ENST00000284116 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
GDPD1-201ENST00000284116 WDR97A6NE52 1622 aa29.31■■■□□ 2.28
GDPD1-201ENST00000284116 ARAP1Q96P48 1450 aa29.23■■■□□ 2.27
GDPD1-201ENST00000284116 CUL7Q14999 1698 aa29.19■■■□□ 2.26
GDPD1-201ENST00000284116 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.17■■■□□ 2.26
GDPD1-201ENST00000284116 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
GDPD1-201ENST00000284116 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.16■■■□□ 2.26
GDPD1-201ENST00000284116 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.14■■■□□ 2.26
GDPD1-201ENST00000284116 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
GDPD1-201ENST00000284116 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
GDPD1-201ENST00000284116 APLP2Q06481 763 aa29.11■■■□□ 2.25
GDPD1-201ENST00000284116 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.1■■■□□ 2.25
GDPD1-201ENST00000284116 WDR62O43379 1518 aa28.98■■■□□ 2.23
GDPD1-201ENST00000284116 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
GDPD1-201ENST00000284116 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.96■■■□□ 2.23
GDPD1-201ENST00000284116 PBRM1Q86U86 1689 aa28.9■■■□□ 2.22
GDPD1-201ENST00000284116 IFT140Q96RY7 1462 aa28.88■■■□□ 2.21
GDPD1-201ENST00000284116 ERCC6Q03468 1493 aa28.87■■■□□ 2.21
GDPD1-201ENST00000284116 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
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