Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.092e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.237e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.27e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 MAP4-208ENST00000429422 3724 ntTSL 1 (best)11.55□□□□□ -0.567e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.837e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.877e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 FCGRT-204ENST00000593381 566 ntTSL 414.67□□□□□ -0.063e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 PRRC2A-210ENST00000483470 916 ntTSL 29.02□□□□□ -0.979e-27■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 TAMM41-202ENST00000411947 1078 ntTSL 219.24■□□□□ 0.675e-9■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.395e-9■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.25e-9■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 TAMM41-210ENST00000494388 1036 ntTSL 215.77■□□□□ 0.125e-9■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.25e-9■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 TAMM41-204ENST00000417723 992 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.425e-9■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 TAMM41-206ENST00000455809 1213 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.565e-9■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 TAMM41-207ENST00000457498 2558 ntTSL 29.4□□□□□ -0.95e-9■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 SF1-206ENST00000413725 843 ntTSL 214.52□□□□□ -0.096e-8■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 TACC3-207ENST00000470808 947 ntTSL 217■□□□□ 0.313e-6■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 TACC3-202ENST00000404054 2771 nt13.82□□□□□ -0.23e-6■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.164e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.94e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.894e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 SAMD1-201ENST00000269724 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.29■■□□□ 11e-17■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 SLC39A4-203ENST00000526658 583 ntTSL 320.69■□□□□ 0.91e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 424.24■■□□□ 1.477e-26■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)23.22■■□□□ 1.313e-26■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 417.4■□□□□ 0.383e-26■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 417.23■□□□□ 0.353e-26■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.71e-6■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.61e-6■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 DCAF12-202ENST00000396990 803 ntTSL 311.56□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 CTSB-211ENST00000526481 660 ntTSL 515.84■□□□□ 0.135e-10■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 TMEM94-232ENST00000585105 5632 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-8■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 TMEM94-217ENST00000581085 5432 ntTSL 213.16□□□□□ -0.32e-8■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.372e-8■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-11■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-11■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.381e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 CRLF1-202ENST00000593286 514 ntTSL 417.13■□□□□ 0.332e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 RAD23A-208ENST00000591499 1350 ntTSL 221.72■■□□□ 1.079e-9■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.662e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.162e-8■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 STK40-208ENST00000482458 900 ntTSL 328.13■■■□□ 2.092e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.832e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 CAPNS1-214ENST00000592483 431 ntTSL 525.87■■□□□ 1.732e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PABPC4-207ENST00000451091 898 ntTSL 325.84■■□□□ 1.732e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.545e-8■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 CAPNS1-212ENST00000591041 812 ntTSL 324.64■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.522e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.472e-8■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.462e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PABPC4-225ENST00000531243 532 ntTSL 423.56■■□□□ 1.362e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.262e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.252e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 STK40-205ENST00000460017 511 ntTSL 521.73■■□□□ 1.072e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.062e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.952e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.92e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 ALG3-206ENST00000446569 967 ntTSL 519.15■□□□□ 0.662e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SSR4-209ENST00000482902 2409 ntTSL 218.3■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 FAM193B-213ENST00000510429 839 ntTSL 318.22■□□□□ 0.519e-10■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 STIP1-210ENST00000540887 877 ntTSL 217.2■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SHISA5-218ENST00000497863 972 ntTSL 217.16■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SSR4-208ENST00000471880 785 ntTSL 516.36■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 HS1BP3-206ENST00000446825 841 ntTSL 316.23■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SSR4-212ENST00000491833 921 ntTSL 316.13■□□□□ 0.171e-10■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-7■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SSR4-207ENST00000471724 443 ntTSL 315.52■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-7■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SSR4-206ENST00000460616 2482 ntTSL 215.03■□□□□ -02e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 214.4□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.132e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 SHISA5-211ENST00000460758 1297 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.142e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 STIP1-204ENST00000536973 738 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 HS1BP3-IT1-201ENST00000449391 600 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 XBP1-206ENST00000484256 2173 ntTSL 212.71□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 512.48□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 RNF220-210ENST00000474394 810 ntTSL 311.94□□□□□ -0.52e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.312e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 TMED10-205ENST00000556969 1314 ntTSL 26.83□□□□□ -1.322e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 FOXK2-204ENST00000527313 779 ntTSL 322.48■■□□□ 1.198e-10■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.028e-10■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)20.65■□□□□ 0.98e-10■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 TCIRG1-208ENST00000529364 868 ntTSL 317.56■□□□□ 0.45e-23■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 FOXK2-207ENST00000570585 756 ntTSL 315.37■□□□□ 0.058e-10■■■□□ 17.3
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 656.2 ms