RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.91■■■■■ 6.86
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCC9O60706 1549 aa53.56■■■■■ 6.16
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.43■■■■■ 5.98
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.33■■■■■ 5.81
CAPNS1-214ENST00000592483 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.5■■■■■ 5.67
CAPNS1-214ENST00000592483 NACADO15069 1562 aa49.89■■■■■ 5.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.72■■■■■ 5.55
CAPNS1-214ENST00000592483 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.4■■■■■ 5.5
CAPNS1-214ENST00000592483 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.27■■■■■ 5.48
CAPNS1-214ENST00000592483 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.05■■■■■ 5.44
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.86■■■■■ 5.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.4■■■■■ 5.34
CAPNS1-214ENST00000592483 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.33■■■■■ 5.33
CAPNS1-214ENST00000592483 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.32■■■■■ 5.33
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.04■■■■■ 5.28
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.26
CAPNS1-214ENST00000592483 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.79■■■■■ 5.24
CAPNS1-214ENST00000592483 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
CAPNS1-214ENST00000592483 SCRIBQ14160 1630 aa47.66■■■■■ 5.22
CAPNS1-214ENST00000592483 CUX2O14529 1486 aa46.68■■■■■ 5.06
CAPNS1-214ENST00000592483 ERCC6Q03468 1493 aa46.35■■■■■ 5.01
CAPNS1-214ENST00000592483 NCAPD3P42695 1498 aa46.11■■■■■ 4.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.76■■■■■ 4.92
CAPNS1-214ENST00000592483 NESP48681 1621 aa45.67■■■■■ 4.9
CAPNS1-214ENST00000592483 HMGXB3Q12766 1538 aa45.6■■■■■ 4.89
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCA2P51531 1590 aa45.57■■■■■ 4.89
CAPNS1-214ENST00000592483 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCA4P51532 1647 aa45.38■■■■■ 4.86
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM41Q8WV44 630 aa45.37■■■■■ 4.85
CAPNS1-214ENST00000592483 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.2■■■■■ 4.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.02■■■■■ 4.8
CAPNS1-214ENST00000592483 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45■■■■■ 4.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.99■■■■■ 4.79
CAPNS1-214ENST00000592483 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.66■■■■■ 4.74
CAPNS1-214ENST00000592483 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.65■■■■■ 4.74
CAPNS1-214ENST00000592483 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.58■■■■■ 4.73
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR62O43379 1518 aa44.58■■■■■ 4.73
CAPNS1-214ENST00000592483 OSCARQ8IYS5 282 aa44.42■■■■■ 4.7
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.24■■■■■ 4.67
CAPNS1-214ENST00000592483 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.1■■■■■ 4.65
CAPNS1-214ENST00000592483 WIZO95785 1651 aa43.96■■■■■ 4.63
CAPNS1-214ENST00000592483 CFTRP13569 1480 aa43.88■■■■■ 4.61
CAPNS1-214ENST00000592483 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.85■■■■■ 4.61
CAPNS1-214ENST00000592483 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.85■■■■■ 4.61
CAPNS1-214ENST00000592483 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.85■■■■■ 4.61
CAPNS1-214ENST00000592483 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF11O15085 1522 aa43.63■■■■■ 4.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.43■■■■■ 4.54
CAPNS1-214ENST00000592483 IFT140Q96RY7 1462 aa43.43■■■■■ 4.54
CAPNS1-214ENST00000592483 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
CAPNS1-214ENST00000592483 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
CAPNS1-214ENST00000592483 PRDM2Q13029 1718 aa43.24■■■■■ 4.51
CAPNS1-214ENST00000592483 TOPBP1Q92547 1522 aa43.13■■■■■ 4.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ARAP1Q96P48 1450 aa43.11■■■■■ 4.49
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCC8Q09428 1581 aa43.02■■■■■ 4.48
CAPNS1-214ENST00000592483 CHD1O14646 1710 aa42.99■■■■■ 4.47
CAPNS1-214ENST00000592483 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.93■■■■■ 4.468e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-214ENST00000592483 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.91■■■■■ 4.46
CAPNS1-214ENST00000592483 FBLN2P98095 1184 aa42.9■■■■■ 4.46
CAPNS1-214ENST00000592483 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.86■■■■■ 4.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
CAPNS1-214ENST00000592483 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.52■■■■■ 4.4
CAPNS1-214ENST00000592483 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
CAPNS1-214ENST00000592483 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.48■■■■■ 4.39
CAPNS1-214ENST00000592483 SOGA1O94964 1423 aa42.44■■■■■ 4.38
CAPNS1-214ENST00000592483 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
CAPNS1-214ENST00000592483 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.42■■■■■ 4.38
CAPNS1-214ENST00000592483 SYNJ1O43426 1573 aa42.39■■■■■ 4.38
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR97A6NE52 1622 aa42.33■■■■■ 4.37
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIN2BQ13224 1484 aa42.19■■■■■ 4.34
CAPNS1-214ENST00000592483 SYNJ2O15056 1496 aa42.18■■■■■ 4.34
CAPNS1-214ENST00000592483 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.18■■■■■ 4.34
CAPNS1-214ENST00000592483 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.17■■■■■ 4.34
CAPNS1-214ENST00000592483 CUX1P39880 1505 aa41.95■■■■■ 4.31
CAPNS1-214ENST00000592483 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
CAPNS1-214ENST00000592483 PBRM1Q86U86 1689 aa41.85■■■■■ 4.29
CAPNS1-214ENST00000592483 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.75■■■■■ 4.27
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.66■■■■■ 4.26
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.66■■■■■ 4.26
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIN2AQ12879 1464 aa41.62■■■■■ 4.25
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP170Q5SW79 1584 aa41.61■■■■■ 4.25
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP160Q12769 1436 aa41.55■■■■■ 4.24
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.53■■■■■ 4.24
CAPNS1-214ENST00000592483 SHROOM2Q13796 1616 aa41.47■■■■■ 4.23
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTS12P58397 1594 aa41.41■■■■■ 4.22
CAPNS1-214ENST00000592483 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.32■■■■■ 4.21
CAPNS1-214ENST00000592483 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.28■■■■■ 4.2
CAPNS1-214ENST00000592483 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.24■■■■■ 4.19
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.19■■■■■ 4.18
CAPNS1-214ENST00000592483 JPH4Q96JJ6 628 aa41.18■■■■■ 4.18
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