RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.66■■■■□ 3.62
SSR4-201ENST00000320857 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.76■■■□□ 2.84
SSR4-201ENST00000320857 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
SSR4-201ENST00000320857 ABCC9O60706 1549 aa31.58■■■□□ 2.65
SSR4-201ENST00000320857 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.16■■■□□ 2.58
SSR4-201ENST00000320857 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31■■■□□ 2.55
SSR4-201ENST00000320857 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.86■■■□□ 2.53
SSR4-201ENST00000320857 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.74■■■□□ 2.51
SSR4-201ENST00000320857 NACADO15069 1562 aa30.48■■■□□ 2.47
SSR4-201ENST00000320857 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.43■■■□□ 2.46
SSR4-201ENST00000320857 SCRIBQ14160 1630 aa30.13■■■□□ 2.41
SSR4-201ENST00000320857 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SSR4-201ENST00000320857 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.8■■■□□ 2.36
SSR4-201ENST00000320857 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.34
SSR4-201ENST00000320857 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.51■■■□□ 2.31
SSR4-201ENST00000320857 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
SSR4-201ENST00000320857 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.24■■■□□ 2.27
SSR4-201ENST00000320857 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.1■■■□□ 2.25
SSR4-201ENST00000320857 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
SSR4-201ENST00000320857 SMARCA4P51532 1647 aa28.91■■■□□ 2.22
SSR4-201ENST00000320857 WIZO95785 1651 aa28.87■■■□□ 2.21
SSR4-201ENST00000320857 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.84■■■□□ 2.21
SSR4-201ENST00000320857 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SSR4-201ENST00000320857 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.62■■■□□ 2.17
SSR4-201ENST00000320857 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
SSR4-201ENST00000320857 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.57■■■□□ 2.16
SSR4-201ENST00000320857 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.52■■■□□ 2.16
SSR4-201ENST00000320857 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.4■■■□□ 2.14
SSR4-201ENST00000320857 SMARCA2P51531 1590 aa28.38■■■□□ 2.13
SSR4-201ENST00000320857 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.29■■■□□ 2.12
SSR4-201ENST00000320857 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SSR4-201ENST00000320857 NCAPD3P42695 1498 aa28.13■■■□□ 2.09
SSR4-201ENST00000320857 TRIM41Q8WV44 630 aa28.11■■■□□ 2.09
SSR4-201ENST00000320857 HMGXB3Q12766 1538 aa28.1■■■□□ 2.09
SSR4-201ENST00000320857 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.75■■■□□ 2.03
SSR4-201ENST00000320857 ABCC8Q09428 1581 aa27.74■■■□□ 2.03
SSR4-201ENST00000320857 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
SSR4-201ENST00000320857 CFTRP13569 1480 aa27.55■■■□□ 2
SSR4-201ENST00000320857 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.55■■■□□ 2
SSR4-201ENST00000320857 NESP48681 1621 aa27.45■■□□□ 1.98
SSR4-201ENST00000320857 PRDM2Q13029 1718 aa27.43■■□□□ 1.98
SSR4-201ENST00000320857 SYNJ1O43426 1573 aa27.43■■□□□ 1.98
SSR4-201ENST00000320857 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.42■■□□□ 1.98
SSR4-201ENST00000320857 EEA1Q15075 1411 aa27.34■■□□□ 1.97
SSR4-201ENST00000320857 TOP2BQ02880 1626 aa27.32■■□□□ 1.96
SSR4-201ENST00000320857 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.32■■□□□ 1.96
SSR4-201ENST00000320857 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.29■■□□□ 1.96
SSR4-201ENST00000320857 SOGA1O94964 1423 aa27.27■■□□□ 1.96
SSR4-201ENST00000320857 CUX1P39880 1505 aa27.19■■□□□ 1.94
SSR4-201ENST00000320857 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.19■■□□□ 1.94
SSR4-201ENST00000320857 ERCC6Q03468 1493 aa27.17■■□□□ 1.94
SSR4-201ENST00000320857 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.16■■□□□ 1.94
SSR4-201ENST00000320857 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.15■■□□□ 1.94
SSR4-201ENST00000320857 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.15■■□□□ 1.94
SSR4-201ENST00000320857 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.1■■□□□ 1.93
SSR4-201ENST00000320857 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.1■■□□□ 1.93
SSR4-201ENST00000320857 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.99■■□□□ 1.91
SSR4-201ENST00000320857 GOLGA3Q08378 1498 aa26.98■■□□□ 1.91
SSR4-201ENST00000320857 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.98■■□□□ 1.91
SSR4-201ENST00000320857 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.94■■□□□ 1.9
SSR4-201ENST00000320857 KIF21BO75037 1637 aa26.92■■□□□ 1.9
SSR4-201ENST00000320857 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.9■■□□□ 1.9
SSR4-201ENST00000320857 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SSR4-201ENST00000320857 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.87■■□□□ 1.89
SSR4-201ENST00000320857 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SSR4-201ENST00000320857 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.85■■□□□ 1.89
SSR4-201ENST00000320857 CEP162Q5TB80 1403 aa26.85■■□□□ 1.89
SSR4-201ENST00000320857 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SSR4-201ENST00000320857 KIF27Q86VH2 1401 aa26.84■■□□□ 1.89
SSR4-201ENST00000320857 TOPBP1Q92547 1522 aa26.84■■□□□ 1.89
SSR4-201ENST00000320857 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SSR4-201ENST00000320857 CUX2O14529 1486 aa26.73■■□□□ 1.87
SSR4-201ENST00000320857 PRXQ9BXM0 1461 aa26.72■■□□□ 1.87
SSR4-201ENST00000320857 WDR62O43379 1518 aa26.72■■□□□ 1.87
SSR4-201ENST00000320857 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SSR4-201ENST00000320857 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.69■■□□□ 1.86
SSR4-201ENST00000320857 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.69■■□□□ 1.86
SSR4-201ENST00000320857 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.65■■□□□ 1.86
SSR4-201ENST00000320857 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.63■■□□□ 1.85
SSR4-201ENST00000320857 IGF1RP08069 1367 aa26.6■■□□□ 1.85
SSR4-201ENST00000320857 CLIP1P30622 1438 aa26.55■■□□□ 1.84
SSR4-201ENST00000320857 WDR97A6NE52 1622 aa26.55■■□□□ 1.84
SSR4-201ENST00000320857 HRCP23327 699 aa26.51■■□□□ 1.83
SSR4-201ENST00000320857 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.46■■□□□ 1.83
SSR4-201ENST00000320857 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SSR4-201ENST00000320857 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.42■■□□□ 1.82
SSR4-201ENST00000320857 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SSR4-201ENST00000320857 IFT140Q96RY7 1462 aa26.39■■□□□ 1.81
SSR4-201ENST00000320857 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.38■■□□□ 1.81
SSR4-201ENST00000320857 CUL7Q14999 1698 aa26.38■■□□□ 1.81
SSR4-201ENST00000320857 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SSR4-201ENST00000320857 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.35■■□□□ 1.81
SSR4-201ENST00000320857 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SSR4-201ENST00000320857 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SSR4-201ENST00000320857 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.791e-7■■■■■ 36.9
SSR4-201ENST00000320857 ARAP1Q96P48 1450 aa26.21■■□□□ 1.79
SSR4-201ENST00000320857 APLP2Q06481 763 aa26.2■■□□□ 1.78
SSR4-201ENST00000320857 PBRM1Q86U86 1689 aa26.18■■□□□ 1.78
SSR4-201ENST00000320857 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SSR4-201ENST00000320857 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms