Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 ARHGAP21-211ENST00000476499 1612 ntTSL 213.14□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 CCNK-203ENST00000553865 5627 ntTSL 1 (best)9.31□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.68□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 ARHGAP21-204ENST00000416305 801 ntTSL 52.28□□□□□ -2.042e-7■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 APBA2-210ENST00000559814 2555 ntTSL 1 (best)19.84■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 EDC3-204ENST00000562174 761 ntTSL 213.07□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 140.6
SF3B1O75533 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.38e-9■■■■■ 140.5
SF3B1O75533 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.658e-9■■■■■ 140.5
SF3B1O75533 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.878e-9■■■■■ 140.5
SF3B1O75533 MTHFD2-205ENST00000470592 1396 ntTSL 29.24□□□□□ -0.938e-9■■■■■ 140.5
SF3B1O75533 MTHFD2-207ENST00000488086 483 ntTSL 29.1□□□□□ -0.958e-9■■■■■ 140.5
SF3B1O75533 MTHFD2-208ENST00000489041 1135 ntTSL 29.06□□□□□ -0.968e-9■■■■■ 140.5
SF3B1O75533 MTHFD2-206ENST00000477455 696 ntTSL 38.19□□□□□ -1.18e-9■■■■■ 140.5
SF3B1O75533 OSBPL5-206ENST00000471998 2182 ntTSL 219.93■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 OSBPL5-219ENST00000534491 2224 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -03e-6■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 GATAD2B-202ENST00000634401 867 ntTSL 518.06■□□□□ 0.484e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 GATAD2B-210ENST00000637331 145 ntTSL 515.2■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.494e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 GATAD2B-207ENST00000634791 642 ntTSL 39.28□□□□□ -0.924e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.054e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 ZFYVE28-205ENST00000508184 541 ntTSL 418.59■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 B3GNTL1-206ENST00000571954 881 ntTSL 515.32■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 MBTD1-202ENST00000405860 3224 ntTSL 512.74□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 KDM6B-204ENST00000571047 362 ntTSL 511.61□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 ETV6-202ENST00000396373 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 MBTD1-206ENST00000591270 2163 ntTSL 25.03□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 JMJD1C-205ENST00000469152 734 ntTSL 33.69□□□□□ -1.822e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 JMJD1C-207ENST00000489372 913 ntTSL 52.81□□□□□ -1.962e-9■■■■■ 140.4
SF3B1O75533 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.415e-6■■■■■ 140.2
SF3B1O75533 ARAP1-216ENST00000542596 699 ntTSL 516.2■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 140.2
SF3B1O75533 ARAP1-211ENST00000495878 2758 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 140.2
SF3B1O75533 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 140.2
SF3B1O75533 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 140.2
SF3B1O75533 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC8.3□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 140.2
SF3B1O75533 GNAQ-202ENST00000411677 551 ntTSL 311.13□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 140.2
SF3B1O75533 LIG3-201ENST00000262327 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 140.2
SF3B1O75533 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 140.1
SF3B1O75533 MTMR14-210ENST00000447144 1664 ntTSL 224.29■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 140.1
SF3B1O75533 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 140.1
SF3B1O75533 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 140.1
SF3B1O75533 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 140.1
SF3B1O75533 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 140.1
SF3B1O75533 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 140.1
SF3B1O75533 SLC26A6-220ENST00000489483 5682 ntTSL 214.98□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 140
SF3B1O75533 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 140
SF3B1O75533 SLC26A6-217ENST00000480524 2727 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 140
SF3B1O75533 STXBP2-220ENST00000601061 706 ntTSL 322.22■■□□□ 1.153e-13■■■■■ 139.9
SF3B1O75533 STXBP2-208ENST00000595800 1974 ntTSL 221.42■■□□□ 1.023e-13■■■■■ 139.9
SF3B1O75533 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 139.9
SF3B1O75533 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 139.9
SF3B1O75533 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 139.9
SF3B1O75533 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 139.9
SF3B1O75533 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 139.9
SF3B1O75533 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 39.75□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 139.8
SF3B1O75533 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.067e-9■■■■■ 139.8
SF3B1O75533 FAM193B-214ENST00000510479 2800 ntTSL 212.34□□□□□ -0.435e-9■■■■■ 139.7
SF3B1O75533 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 139.7
SF3B1O75533 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 139.7
SF3B1O75533 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 139.7
SF3B1O75533 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 139.7
SF3B1O75533 CTBP1-216ENST00000514669 809 ntTSL 318.57■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 139.7
SF3B1O75533 SNTB2-203ENST00000467311 1489 ntTSL 1 (best)23.76■■□□□ 1.394e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SCARB2-212ENST00000638663 1922 ntTSL 522.64■■□□□ 1.214e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 HDAC7-212ENST00000434070 645 ntTSL 419.61■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 HDAC7-204ENST00000417107 569 ntTSL 419.61■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 HDAC7-205ENST00000417902 576 ntTSL 319.6■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 HDAC7-213ENST00000440293 580 ntTSL 419.6■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 HDAC7-208ENST00000425451 621 ntTSL 519.45■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SCARB2-213ENST00000638680 5817 ntTSL 518.67■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 HDAC7-210ENST00000430670 914 ntTSL 518.53■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-202ENST00000584900 1636 ntTSL 218.34■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SPINT1-209ENST00000568580 1417 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.13■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 FAM178B-203ENST00000478671 542 ntTSL 417.38■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-201ENST00000579700 1222 ntTSL 217.05■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 HDAC7-211ENST00000433685 402 ntTSL 317.04■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 FAM178B-206ENST00000520074 574 ntTSL 515.51■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SCARB2-221ENST00000640341 3403 ntTSL 514.85□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 HDAC7-215ENST00000447463 555 ntTSL 414.6□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SCARB2-208ENST00000638372 4811 ntTSL 514.57□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 SCARB2-216ENST00000639300 4554 ntTSL 514.53□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 139.6
SF3B1O75533 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 139.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1690.3 ms