Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6E7

SIRT4, NAD-dependent protein lipoamidase sirtuin-4, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT4Q9Y6E7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIRT4Q9Y6E7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT4Q9Y6E7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT4Q9Y6E7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms