Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms