Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC3IPQ9P2W1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMC3IPQ9P2W1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms