Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT2Q9NZN8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT2Q9NZN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT2Q9NZN8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms