Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A3Q9NQ40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A3Q9NQ40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A3Q9NQ40 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A3Q9NQ40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A3Q9NQ40 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A3Q9NQ40 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC52A3Q9NQ40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC52A3Q9NQ40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC52A3Q9NQ40 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A3Q9NQ40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A3Q9NQ40 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A3Q9NQ40 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms