Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC21

SLC25A19, Mitochondrial thiamine pyrophosphate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A19Q9HC21 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC25A19Q9HC21 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A19Q9HC21 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A19Q9HC21 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A19Q9HC21 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A19Q9HC21 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A19Q9HC21 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A19Q9HC21 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms