Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP1Q9H902 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
REEP1Q9H902 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
REEP1Q9H902 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP1Q9H902 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms