Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF4Q9BQW3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF4Q9BQW3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF4Q9BQW3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms