Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC136Q96JN2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC136Q96JN2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC136Q96JN2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC136Q96JN2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC136Q96JN2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC136Q96JN2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms