Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3IL1Q8TBN0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB3IL1Q8TBN0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms