Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAB3IL1Q8TBN0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAB3IL1Q8TBN0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAB3IL1Q8TBN0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RAB3IL1Q8TBN0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RAB3IL1Q8TBN0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB3IL1Q8TBN0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RAB3IL1Q8TBN0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAB3IL1Q8TBN0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAB3IL1Q8TBN0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RAB3IL1Q8TBN0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RAB3IL1Q8TBN0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RAB3IL1Q8TBN0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RAB3IL1Q8TBN0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RAB3IL1Q8TBN0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RAB3IL1Q8TBN0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAB3IL1Q8TBN0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RAB3IL1Q8TBN0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RAB3IL1Q8TBN0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RAB3IL1Q8TBN0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RAB3IL1Q8TBN0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAB3IL1Q8TBN0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RAB3IL1Q8TBN0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAB3IL1Q8TBN0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAB3IL1Q8TBN0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB3IL1Q8TBN0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAB3IL1Q8TBN0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAB3IL1Q8TBN0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAB3IL1Q8TBN0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RAB3IL1Q8TBN0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAB3IL1Q8TBN0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAB3IL1Q8TBN0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAB3IL1Q8TBN0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RAB3IL1Q8TBN0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAB3IL1Q8TBN0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB3IL1Q8TBN0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAB3IL1Q8TBN0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAB3IL1Q8TBN0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAB3IL1Q8TBN0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAB3IL1Q8TBN0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB3IL1Q8TBN0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB3IL1Q8TBN0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB3IL1Q8TBN0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB3IL1Q8TBN0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB3IL1Q8TBN0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB3IL1Q8TBN0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB3IL1Q8TBN0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB3IL1Q8TBN0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB3IL1Q8TBN0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB3IL1Q8TBN0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB3IL1Q8TBN0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB3IL1Q8TBN0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB3IL1Q8TBN0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3IL1Q8TBN0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3IL1Q8TBN0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB3IL1Q8TBN0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAB3IL1Q8TBN0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB3IL1Q8TBN0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB3IL1Q8TBN0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAB3IL1Q8TBN0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB3IL1Q8TBN0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB3IL1Q8TBN0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB3IL1Q8TBN0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB3IL1Q8TBN0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB3IL1Q8TBN0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB3IL1Q8TBN0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB3IL1Q8TBN0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3IL1Q8TBN0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB3IL1Q8TBN0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB3IL1Q8TBN0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3IL1Q8TBN0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3IL1Q8TBN0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB3IL1Q8TBN0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB3IL1Q8TBN0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB3IL1Q8TBN0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB3IL1Q8TBN0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB3IL1Q8TBN0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB3IL1Q8TBN0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB3IL1Q8TBN0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB3IL1Q8TBN0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB3IL1Q8TBN0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB3IL1Q8TBN0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB3IL1Q8TBN0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB3IL1Q8TBN0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB3IL1Q8TBN0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB3IL1Q8TBN0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB3IL1Q8TBN0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB3IL1Q8TBN0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB3IL1Q8TBN0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms