Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOXF1Q8NHV9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOXF1Q8NHV9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF1Q8NHV9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms