Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG16L1Q676U5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATG16L1Q676U5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG16L1Q676U5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG16L1Q676U5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms