Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATG16L1Q676U5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATG16L1Q676U5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ATG16L1Q676U5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
ATG16L1Q676U5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATG16L1Q676U5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATG16L1Q676U5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ATG16L1Q676U5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG16L1Q676U5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG16L1Q676U5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ATG16L1Q676U5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATG16L1Q676U5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATG16L1Q676U5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATG16L1Q676U5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATG16L1Q676U5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATG16L1Q676U5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATG16L1Q676U5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATG16L1Q676U5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATG16L1Q676U5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATG16L1Q676U5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATG16L1Q676U5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATG16L1Q676U5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATG16L1Q676U5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATG16L1Q676U5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATG16L1Q676U5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATG16L1Q676U5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG16L1Q676U5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATG16L1Q676U5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG16L1Q676U5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATG16L1Q676U5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATG16L1Q676U5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATG16L1Q676U5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATG16L1Q676U5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATG16L1Q676U5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG16L1Q676U5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG16L1Q676U5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG16L1Q676U5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG16L1Q676U5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG16L1Q676U5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG16L1Q676U5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG16L1Q676U5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATG16L1Q676U5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATG16L1Q676U5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATG16L1Q676U5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATG16L1Q676U5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG16L1Q676U5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATG16L1Q676U5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG16L1Q676U5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG16L1Q676U5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG16L1Q676U5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG16L1Q676U5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG16L1Q676U5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG16L1Q676U5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATG16L1Q676U5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG16L1Q676U5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG16L1Q676U5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATG16L1Q676U5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG16L1Q676U5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG16L1Q676U5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG16L1Q676U5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG16L1Q676U5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG16L1Q676U5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG16L1Q676U5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG16L1Q676U5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATG16L1Q676U5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG16L1Q676U5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG16L1Q676U5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG16L1Q676U5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG16L1Q676U5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG16L1Q676U5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG16L1Q676U5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG16L1Q676U5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG16L1Q676U5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG16L1Q676U5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG16L1Q676U5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG16L1Q676U5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG16L1Q676U5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG16L1Q676U5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG16L1Q676U5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG16L1Q676U5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATG16L1Q676U5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG16L1Q676U5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG16L1Q676U5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG16L1Q676U5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG16L1Q676U5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG16L1Q676U5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG16L1Q676U5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG16L1Q676U5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG16L1Q676U5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG16L1Q676U5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG16L1Q676U5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG16L1Q676U5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG16L1Q676U5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG16L1Q676U5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG16L1Q676U5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG16L1Q676U5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG16L1Q676U5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG16L1Q676U5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG16L1Q676U5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG16L1Q676U5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms