Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SP6Q3SY56 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SP6Q3SY56 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SP6Q3SY56 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP6Q3SY56 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SP6Q3SY56 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP6Q3SY56 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SP6Q3SY56 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP6Q3SY56 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SP6Q3SY56 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SP6Q3SY56 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP6Q3SY56 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP6Q3SY56 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SP6Q3SY56 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SP6Q3SY56 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SP6Q3SY56 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SP6Q3SY56 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SP6Q3SY56 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SP6Q3SY56 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP6Q3SY56 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP6Q3SY56 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP6Q3SY56 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SP6Q3SY56 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SP6Q3SY56 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms