Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL1Q13616 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CUL1Q13616 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL1Q13616 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL1Q13616 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
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